Die Kirche wurde im Jahr 1339 fertiggestellt und der Hl. Mutter Anna geweiht. Sie ist der herausragende Mittelpunkt des 1286 gegründeten Klosterortes Gotteszell.
Im Jahr 1629 vernichtete ein Brand die Urkirche und fast das gesamte Kloster, doch die Kirche wurde farbenprächtig erneuert.
Daher vereint das Gotteshaus heute mehrere Baustile: romanisch im Grundriss, gotisch in der äußeren Gestaltung, Barock und Rokoko in der Innenausstattung.
Neben Hochaltar, Kanzel, Apostelkapelle und den Fresken im Mittelschiff sind der vordere und hintere Teil der Kirche ein besonderer Blickfang.